Doch dass sie als Frau bei den Minderbrüdern blieb, war für Franziskus völlig undenkbar. In den benachbarten Benediktinerinnen-Konventen wurde sie nicht glücklich und beschloss daher, zusammen mit ihrer Schwester Agnes in San Damiano ein Leben als Einsiedlerin zu führen. Aus dieser Keimzelle wurde schnell eine Frauengemeinschaft, die sich der Armut verschrieb. Klara lebte in so strenger Askese und kompromissloser religiöser Hingabe, dass selbst Franziskus sie zu Mäßigung ermahnte. Bis an ihr Lebensende kämpfte sie um die päpstliche Anerkennung ihrer Lebensregel. Ihr und ihren Schwestern wurde strengste Klausur auferlegt, denn Nonnen war ein öffentliches Wirken in tätiger Nächstenliebe untersagt. Die radikale Armut aber wurde als entscheidendes Element in die Regel des Klarissen-Ordens aufgenommen.
