Schlutterbauers Hexereivorwürfe griff Jesuitenpater Georg Scherer auf. In einer flammenden Predigt vor dem Wiener Stephansdom klagte er Elsa der Hexerei an. Nach mehrmaliger grausamer Folter, in der sie alles gestand, wurde Elsa Plainacher am 27. September 1583 auf dem Scheiterhaufen hingerichtet. Es war dies der einzige Hexenprozess, der in Wien je geführt wurde, während europaweit bis ins 18. Jahrhundert etwa 50 000 der Hexerei beschuldigte Männer und Frauen ihr Leben lassen mussten. Georg Scherer führte seinen Feldzug gegen Hexen und den Protestantismus mit großem Eifer fort. Im Jahr 1605 fiel er während einer Predigt in Linz vom Schlaganfall getroffen tot von der Kanzel. In Erinnerung an sein Opfer trägt eine Gasse in Wiens 22. Bezirk den Namen Elsa Plainachers.
