Am 4. April 1460 fand schließlich im Münster der Stadt die offizielle Eröffnung der Universität Basel, der ältesten Universität der Schweiz, statt. In einem feierlichen Gottesdienst ließ Bischof Johannes die päpstliche Stiftungsurkunde verlesen. Als Kanzler fiel es ihm zu, den Rektor der neugegründeten Universität zu ernennen. Seine Wahl fiel auf den Dompropst von Basel, Georg von Andlo. Schon am Tag nach der Eröffnung nahm die Universität in allen vier Fakultäten, in der Artistenfakultät sowie der theologischen, der juristischen und der medizinischen Fakultät, den Lehrbetrieb auf und entwickelte sich in den folgenden Jahrzehnten zu einem wichtigen Zentrum des Humanismus.
