Bis zum Umzug der Familie nach Leipzig 1723 blieb sie in ihrer Stellung. Danach hatte sie nur noch wenige Gelegenheiten zu öffentlichen Auftritten, aber im Rahmen von Hausmusiken sang sie weiter. Für ihren Mann war Anna Magdalena außerdem eine unermüdliche Kopistin; viele seiner Werke sind in ihrer Handschrift überliefert. Sie lieferte die Rahmenbedingungen für sein Genie, trotz immenser Belastungen als Hausfrau und Mutter: Zwischen 1723 und 1742 brachte sie 13 Kinder zur Welt, von denen sieben schon im frühen Kindesalter starben. Zu dem vielköpfigen Haushalt gehörten außerdem stets auch Schüler und Gäste. Anna Magdalena überlebte ihren Mann um acht Jahre und starb 1758 in Leipzig.
