Mit einer Hetzpredigt gegen die Beschuldigte wiegelte der Jesuitenprediger Georg Scherer die Bevölkerung Wiens schließlich so auf, dass Elsa gefangen genommen und der Folter unterzogen wurde. Am 27. September 1583 verbrannte man sie auf der Wiener Hinrichtungsstätte „Gänsweyd“ auf dem Scheiterhaufen. Sie war nicht die einzige Beschuldigte in Österreich, die wegen angeblicher Hexerei hingerichtet wurde, doch erregte ihr Fall in der Öffentlichkeit großes Aufsehen.
