1672 als Sohn eines Arztes in Zürich geboren, fühlte sich Johann Jakob Scheuchzer früh zu Naturwissenschaften hingezogen. In Altdorf bei Nürnberg und im niederländischen Utrecht studierte er Medizin. Zu dieser Zeit begann er zudem, sich für Botanik zu interessieren. Wenn er keine Vorlesungen besuchte, durchstreifte er seine Umgebung auf der Suche nach Pflanzen für Studienzwecke. Später wirkte Scheuchzer als Arzt in Zürich – eine Anstellung als Leibarzt Peters des Großen, für die ihn Gottfried Wilhelm Leibniz 1710 dem russischen Zaren empfohlen hatte, lehnte er ab. Sein Hauptinteresse galt jedoch der Erforschung der Schweizer Gebirgswelt. Darüber hinaus war er Dozent und Kurator der Bürgerbibliothek und der Kunstkammer in Zürich.